理解CpG Islands

CpG Islands是指CG组合明显高于全基因组平均水平的DNA片段,通常靠近基因的转录起始位点,可以调节基因的转录活性。

在哺乳动物的DNA中,CG这样的组合十分稀少,原因在于,CG中的C易被甲基化,而甲基化的C由于脱氨作用会转变成T,即CG有转化为TG的倾向,除非因某种原因,CG中的C不被甲基化,CG组合才得以保留。

一般,CpG Islands有如下特征:

1)GC含量高于50%;
2)片段长度大于200 bp;
3)CG组合观测值/预测值 > 0.6;

  • 本文作者:括囊无誉
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